在视图中怎么组织css与js文件呢？

哈呜

按如下按个视图文件组合成一个页面：
view/header.php      --> 引入 site.css
view/content.php
      --> 引入 plugin.css
      --> 引入 plugin.js
      --> 引入一段javascript代码
view/footer.php
      --> 引入 site.js

这样的话，在生成的页面里面。 就会出现plugin.css、plugin.js以及一段javascript代码嵌在页面源代码中间。像这样子。
   site.css
   ......
   plugin.css
   plugin.js
   javascript
   ......
   site.js


但按道理我们想要的效果应该是:
   site.css
   plugin.css
   ......
   site.js
   plugin.js
   javascript

请问我应该怎么解决这个问题比较好？