网站部署后出现404页面

月光疾风

起初是用wamp来加载ci，做了一个简单的网站，在本地访问是正常的。我的目录结构没有做任何改动
/root
   /application
   /system
   /misc
   index.php
根据手册上说的，入口文件的application和system都是保持默认设置。config.php文件中的base_url改成了本地地址。
当我今天把网站部署到linux的时候，只修改了base_url，改成了网站的域名，但是访问时显示404.
我想问一下，到底哪里设置不对了？

PS:我在内网都测试过了，不论是wamp还是linux，都是可以正常访问的。就是上传到ipage的虚拟主机后，怎么弄都是404.